Protein–RNA interactions for Protein: Q80YV2

Zc3hc1, Nuclear-interacting partner of ALK, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3hc1Q80YV2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3hc1Q80YV2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3hc1Q80YV2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3hc1Q80YV2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms