Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Zbed4Q80WQ9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Zbed4Q80WQ9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Zbed4Q80WQ9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Zbed4Q80WQ9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed4Q80WQ9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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