Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms