Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep170bQ80U49 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep170bQ80U49 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms