Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms