Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf516Q7TSH3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms