Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms