Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms