Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms