Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN98

Cpeb4, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb4Q7TN98 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpeb4Q7TN98 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms