Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms