Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncripQ7TMK9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms