Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cd3eapQ76KJ5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd3eapQ76KJ5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms