Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms