Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms