Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Usp34Q6ZQ93 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Usp34Q6ZQ93 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Usp34Q6ZQ93 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Usp34Q6ZQ93 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp34Q6ZQ93 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Usp34Q6ZQ93 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Usp34Q6ZQ93 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Usp34Q6ZQ93 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Usp34Q6ZQ93 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Usp34Q6ZQ93 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp34Q6ZQ93 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms