Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Efr3bQ6ZQ18 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Efr3bQ6ZQ18 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Efr3bQ6ZQ18 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Efr3bQ6ZQ18 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Efr3bQ6ZQ18 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Efr3bQ6ZQ18 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Efr3bQ6ZQ18 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Efr3bQ6ZQ18 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms