Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms