Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms