Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf653Q6YND2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms