Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssx9Q6XAS3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssx9Q6XAS3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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