Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms