Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms