Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timd4Q6U7R4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms