Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms