Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms