Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HjurpQ6PG16 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms