Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms