Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrm2bQ6PEE3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms