Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mfsd4aQ6PDC8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms