Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms