Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCM2

Ints6, Integrator complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ints6Q6PCM2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ints6Q6PCM2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ints6Q6PCM2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms