Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nwd2Q6P5U7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nwd2Q6P5U7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms