Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smchd1Q6P5D8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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