Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms