Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms