Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms