Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms