Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc3bQ6NWW9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms