Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms