Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms