Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6aQ6IE21 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms