Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw2Q6I6G8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hecw2Q6I6G8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms