Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nckap5lQ6GQX2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms