Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q6GQU0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6GQU0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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