Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms