Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Smarca2Q6DIC0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms