Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop58Q6DFW4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms