Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms