Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Pdzrn3Q69ZS0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Pdzrn3Q69ZS0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Pdzrn3Q69ZS0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Pdzrn3Q69ZS0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Pdzrn3Q69ZS0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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